Peter Pellegrini neodpovedá konzistentne na otázku, či by súhlasil s povinným očkovaním konkrétnych skupín osôb.
Keď sa Petra Pellegriniho v júli 2020 v relácii Na telo televízie Markíza pýtali, či by bol za povinné očkovanie najohrozenejších skupín obyvateľstva, odpovedal súhlasne. Po jedenástich mesiacoch má opačný názor, povinné očkovanie na tlačovej konferencii označil za „perverzné“. V rovnakej relácii na rovnakú otázku tentoraz odpovedal nesúhlasne. „Kde sme, aby sme tu niekoho násilím nútili očkovať sa?“ rečnícky sa pýtal šéf strany Hlas-SD.
Ani on sám zaočkovaný nie je, médiám opakovane odpovedá s argumentom, že je to jeho vlastné zdravie a jeho súkromné rozhodnutie, či si dá pichnúť vakcínu proti koronavírusu. Netají sa tým, že je rád, že ochorenie covid-19 prekonal, a preto má protilátky, vďaka ktorým nie je postavený priamo pred rozhodnutie v súvislosti s očkovaním.